[laimas]

Имеете в виду, что лучше делать нативными методами js?

Для простых операций да. jQuery, это не новый язык, это js библиотека и в недрах ее все выполняется на нативном JS, то есть JQ берет на себя все "тяготы" кроссбраузерности или позволяет написать "желаемое" простым выражением, которое на нативном JS будет более объемным.

Но если к примеру в цикле, используя jq метод, или в обработчике событий, когда в методе доступен DOM элемент как this, который имеет свойство value, получать этот элемент как jq объект ради получения его значения - $(this).val(), это и глупо, и не оправдано, ибо это получить проще как this.value.