[Aetae]

Потому что setTimeout никакого отношения к промисам не имеет и "запускает отдельный поток"(на самом деле нет, но так проще для понимания, детали подождут). Промисы вещь в себе, промис ожидает только другой промис.

Promise.resolve() //тоже самое что ваша func только встроенное
.then(() => {
  return new Promise(
    resolve => setTimeout(() => {
      console.log(1);
      resolve();          
    }, 0)
  );
})
.then(() => console.log(2))