https://codepen.io/anon/pen/YRNdmE?editors=1010
Если используете jQuery, то используйте его везде.
В codepen есть специальное поле под js-код, его там и нужно было писать, а не писать часть в одном месте, часть в другом.
Также там имеется возможность подгрузить внешние js/css файлы, т.е. снова нет необходимости вставлять файлы в html.
Ничего править не стал, ибо по хорошему там нужно просто все переписать.