Для эмуляции CSS-свойства opacity в IE jQuery использует фильтр
Alpha. Для всех элементов, к которым применяется фильтр, IE отключает сглаживание текста. Важен факт наличия фильтра, а не значение параметра opacity, поэтому фильтр нужно удалить вообще, что можно сделать очисткой свойства cssText (или удалением подстроки с описанием фильтра), так как jQuery добавляет CSS-стили в атрибут style элемента.