Добрый день. Проблема так и не была решена.
https://fiddle.sencha.com/#view/editor&fiddle/2ovk
Обнаружил что если провести в дебагере хромиума какую либо манипуляцию с padding/ marging для объекта gridheadercontainer то данный пробел в хидере исчезает. при нажатии на заголовок столбца для сортировки, пробел появляется вновь. При это в firefox данного пробела в хидере нет..