Не нашел ничего подходящего.
Пришлось написать плагин-обертку для 'webpack-concat-plugin'.
Repo NPM
github
Корректные SourceMap получаются только в режиме uglify : true.
Если не включать минимизацию, то работает "concat-with-sourcemaps"
issue, а он дает некорректную карту. Когда автор поправит ошибку, тогда можно будет пользоваться режимом без минимификации.
PS: если кто-то найдет другой плагин, просьба отписаться.