[Dethlike]

<div class="wrapper">
        <div class="header">
            <h1>To do list</h1>
            <input type="text" placeholder="Enter some task..." id="toDoEl">
            <span class="addBtn" id="addBtn">Add task</span>
        </div>
        <ul id="list">

        </ul>
        <div class="additionalBtn">
            <button id="clear_all">Clear all</button>
            <button id="all_done">All done</button>
        </div>
 </div>

<style>
* {
    box-sizing: border-box;
}
.wrapper {width: 920px; margin: 0 auto}
ul {
    margin: 0;
    padding: 0;
    list-style: none;
}

ul li {
    cursor: pointer;
    position: relative;
    padding: 12px 8px 12px 40px;
    background: #eee;
    font-size: 18px;
    transition: 0.2s;
    -webkit-user-select: none;
    -moz-user-select: none;
    -ms-user-select: none;
    user-select: none;
}

ul li:nth-child(odd) {
    background: #f9f9f9;
}

ul li:hover {
    background: #ddd;
}

ul li.checked {
    background: #888;
    color: #fff;
    text-decoration: line-through;
}

ul li.checked::before {
    content: '';
    position: absolute;
    border-color: #fff;
    border-style: solid;
    border-width: 0 2px 2px 0;
    top: 10px;
    left: 16px;
    transform: rotate(45deg);
    height: 15px;
    width: 7px;
}
.close {
    position: absolute;
    right: 0;
    top: 0;
    padding: 12px 16px 12px 16px;
}

.close:hover {
    background-color: #f44336;
    color: white;
}

.header {
    background-color: #000;
    padding: 30px 40px;
    color: white;
    text-align: center;
}

.header:after {
    content: "";
    display: table;
    clear: both;
}

input {
    border: none;
    width: 75%;
    padding: 10px;
    float: left;
    font-size: 16px;
}

.addBtn {
    padding: 10px;
    width: 25%;
    background: #d9d9d9;
    color: #555;
    float: left;
    text-align: center;
    font-size: 16px;
    cursor: pointer;
    transition: 0.3s;
}

.addBtn:hover {
    background-color: #bbb;
}
</style>

<script>
    var list = document.querySelector('ul');

    var todos;

    function toLocal() {
        todos = list.innerHTML;
        localStorage.setItem('todos', todos)
    }

    list.addEventListener('click', function (ev) {
        if (ev.target.tagName === "LI") {
            ev.target.classList.toggle('checked');
        } else if (ev.target.tagName === "SPAN") {
            var div = ev.target.parentNode;
            div.remove();
            toLocal();
        }
    }, false);
    document.getElementById("addBtn").addEventListener("click", newElement, false);

    function newElement() {
        var li = document.createElement('li');
        var inputValue = document.getElementById('toDoEl').value;
        var t = document.createTextNode(inputValue);
        li.appendChild(t);
        if (inputValue == "") {
            alert("Введите ваше дело!");
        } else {
            document.getElementById('list').appendChild(li);
        }
        document.getElementById('toDoEl').value = "";
        var span = document.createElement('SPAN');
        var txt = document.createTextNode("X");
        span.className = "close";
        span.appendChild(txt);
        li.appendChild(span);
        toLocal();
    }
    document.getElementById("clear_all").addEventListener("click", clearAll);

    function clearAll() {
        var li = document.querySelector('li');
        li.parentNode.remove(li);
        toLocal();
    }
    document.getElementById("all_done").addEventListener("click", checkedAll);

    function checkedAll() {
        var li = document.querySelectorAll('li');
        li.classList.add('checked');
        toLocal();
    }

    if (localStorage.getItem('todos')) {
        list.innerHTML = localStorage.getItem('todos');
    }
</script>

Помогите пожалуйста, нужно правильно обработать кнопки clear и done all, с первой немного разобрался но после удаления немогу ввести дело заново, а со второй вообще проблемы добился только зачеркивания первого елемента списка, все зачеркнуть не получается....И если кто может пожскажите правильно ли оформленно хранилище, или лучше по другому сделать?