Это сервер неправильно обрабатывает (не обрабатывает) AJAX-запрос к jsp-файлу, в клиентской части вроде все нормально.
Кстати, разработчик ядра Prototype в своем блоге написал, что идея расширять Element.prototype была неудачной, и во 2-й версии фреймворка будет применяться объект-обёртка, как в jQuery.
proof link