[Malleys]

например у меня есть страница first.html со ссылкой
<div id="mylink"></div>

нужно перейти на страницу second.html к якорю #myanchor

js
document.getElementById('mylink').onclick = function(){
window.location.replace("http://second.html#myanchor");
}

Это не ссылка, ссылка делается намного проще!

страница first.html

<a href="second.html#myanchor">Go!</a>

как убрать #myanchor из загрузившейся страницы

на странице second.html добавьте...

<script>

if(location.hash !== "") {
	sessionStorage.hash = location.hash;
	location.replace(location.pathname);
} else {
	if("hash" in sessionStorage) {
		document.querySelector(sessionStorage.hash).scrollIntoView();
		delete sessionStorage.hash;
	}
}

</script>

window.addEventListener("popstate", function () {
       history.pushState('', '', location.pathname)
    });

Событие popstate не происходит при загрузке страницы! Оно происходит при смене активного состояния в истории. А зачем вам в состоянии пустая строка? Кстати, url можно не указывать!