[Malleys]

mineclass[0] // по логике тоже самое secondbox[0]

По какой логике? На самом деле... "secondbox"[0]

Вам нужно переделать так...

var boxes = {
	firstbox: ["-16","13"],
	secondbox: ["-10","11"]
};

то можно так...

var mineclass = this.classList[1];
console.log(mineclass) // вернёт имя класса.

var box = boxes[mineclass]; // выберет нужный массив из boxes
// тут можно устроить проверку, ведь может и не быть класса,
// который вы только добавили в HTML, но в скрипте ещё не добавили массив
var x = box[0];
var y = box[1];