[laimas]

Просто поразмышляйте над этим:

если бы не было вызова функции formatReceipt, в которой получается значение поля form.customerContact.value, то есть текущее на момент отправления формы, то адресат всегда бы получал вот это "customerContact": "+79680810048". Это же и происходит с ценой, поэтому и получать ее нужно при отправлении формы.

Я не знаю зачем вся эта хрень и для чего создается объект, но коли и для него эта сумма нужна, и для яндекса, ну так определите ее в функции, передав обеим:

var formatReceipt = function(form) {
 
        var customerContactValue = form.customerContact.value,
            sum = document.querySelector('input[name=sum]').value;
            //а вот это зачем тогда?
            massivValue.price = {amount: sum}; //это в объект
            
            massivValueObject = JSON.parse(ym.value);
            
            ym.value["items"][0].price.amount = sum; //это в яшку
            
            //далее код