[Raadsert]

Raadsert, пока ты кидаешь огрызки своих программ - ничего путнего не ответить.
Делай полный тестовый пример. Описывай какая операционка у тебя на сервере.
Тогда твой пример при желании можно будет потестить у себя.
Я в своих программах использую вот такой вариант касательно путей

Поскольку разработка ведется на вин-компах, а рабочий сервер уже использует "линуксовые варианты".

Сервер у меня на линуксе. А что на счёт готового варианта, вот...

Дерево каталогов:

module
-index.js // тут запускается функция fs.outputJson()
dir
-foo // в этом каталоге создание файла
--exemple.json

Код из файла index.js:

const fs = require('fs-extra');
const length = fs.readdirSync('../dir/foo').length;

length выдаёт значение количества файлов в каталоге foo.