Файлы стали загружаться на сервер, а вот прогресс бар по прежнему не работает в функции uploadFile. Код я не много изменила, чтобы селекторам было куда ссылаться. В addFiles я добавила следующие строки.
// Создаем строку для таблицы и заполняем её данными.
var row = document.createElement('tr');
row.className = ".id"+index;
var td = document.createElement('td');
td.className = ".size"
var div = document.createElement('div');
row.appendChild(td);
td.appendChild(div);
div.className = ".pbar";