[ksa]

но код вообще зависает

Вот так работает...

alert(JSON.stringify(CreateMatrix2D(2, 3), null, 3))
//
function CreateMatrix2D(Width, Height){
    var MX = [];
	for (var i = 0; i < Height; ++i) {
		var A = [];
		for (var j = 0; j < Width; ++j) {
			A.push({Value: 0});
		}
        MX.push(A);
    }
    return MX;
}