[subzey]

Я обычно делаю так:

<button onclick="run()">run()</button>
<script type="text/javascript">
function run(){
	if (!arguments.callee.runTimes) arguments.callee.runTimes = 0;
	if (++arguments.callee.runTimes > 3){
		alert("Эту функцию можно вызвать только три раза!");
		return;
	};
	/* далее — обычный код функции */
	alert("Я сработало!")
}
</script>

Ну, учитывая, что arguments.callee — это ссылка на функцию, которая сейчас выполняется.