Для начала вынеси callback-функцию и передавай ссылку на неё:
function callback(data){
if (data && data.length == 5){
$("#time").html(data);
//document.getElementById('time').innerHTML = data;
}
}
function gettime(){
$.post('<? echo SITE_URL;?>includes/function_.php?act=que_time', null, callback);
}
setInterval(gettime, 10);
Ну и небольшой рефакторинг. Если не поможет - отруби JQ.
PS: заметь, как все стало намного читабельнее...