Да, конечно "обычно" animate делает все плавно, причем очень плавно 1000/13=77 fps, но в моем случае в адекватных браузерах все более-менее, но ИЕ - просто убивает дерганностью. На хабрахабре единственный совет был почитать вот этот топик
Неплавная анимация скрытых элементов, но у меня нет скрытых элементов и паддинги/марджины у всего по нулям.