Всем спасибо!
Сделал вобщем так:
В scripts.js добавил
function ins_city(city_id,city_name) {
document.s_add.city.options.add(new Option(city_name,city_id,true,true));
}
Ссылки во всплывающем окне заменил на span:
<span onClick=\"if (window.opener){window.opener.ins_city('xxxx','Екатеринбург (2)')};self.close()\">Екатеринбург</span>
Взято
отсюда