подключение внешнего файла аналог include('file') в php
 

У меня есть отдельное меню для сайта(выпадающее на jQuery),которое используется на каждой странице.можно ли его вынести в отдельный файл и подключить с помощью Javascript,допустим как в php include_once('file') и т.п?

Попробуйте это: http://plugins.jquery.com/project/include_js

легко. вынеси всё в один файл скрипта. и подключай этот внешний скрипт на каждой странице.