Передать переменную в дочернее окно
 

Здравствуйте.
Не судите строго, может для вас вопрос покажется и детским, но ответа так и не нашел в Гугле.
Есть родительское окно, в нем переменная $per , как передать её в новое открытое окно, открываю через window.open. В новом окне будет выполнятся некий php код с использованиям этой переменной $per

В окне не может выполняться php. PHP - серверный язык. Браузер его не умеет выполнять.

Запишите $per в $_SESSION, например $_SESSION['per']=$per и юзайте пока хоть одно, любое, окно\вкладка браузера в треде клиента.

На сервере, разумеется.