Заполнение массива JS из MySQL
 

Есть база данных, их которой требуется заполнить массив javascript, а после заполнения вывести из массива select

Откопал только вот такой пример передачи:

<?php
    $user = array('id' => 1, 'name' => 'foo');
?>

<script type="text/javascript" charset="utf-8">
    var user = <?php echo json_encode($user); ?>;
    alert(user.length);
</script>

Но он не работает((((

Он работает, просто Вы его неправильно используете.
В Вашем случае user — обычный объект с полями id и name. Очевидно, что никакого свойства length там нет.