И не мудрено, поскольку эти функции выполняются одновременно:
$('.map_chel2').animate({"right":"290px","top":"90px"},1000);
$('.map_chel2').animate({"right":"395px","top":"235px"},800);
Чтобы выполнить их по очереди:
$('.map_chel2').animate({"right":"290px","top":"90px"},1000,"linear", function() {
$('.map_chel2').animate({"right":"395px","top":"235px"},800);
});