Сборка кода ext со сторонними библиотеками
 

Как мне в выходной бандл сборки приложения включить сторонние библиотеки?

Через эту опцию?

"js": [
        {
            "path": "${framework.dir}/build/ext-all-rtl-debug.js"
        },
        {
            "path": "app.js",
            "bundle": true
        }
    ],

И как сделать мне это в пакете? Там такой опции нет.

Посмотрите app.json в KitchenSink, там есть куча комментариев, описывающих разные опции в секции "js" и пример именно того, что вам нужно:

"js": [
    	{
            "path": "lib/prettify/prettify.js",
            "includeInBundle": true
    	},
        {
            "path": "app.js",
            "bundle": true
        }
    ],

Спасибо! Получилось.
А как сделать это для пакета?
Или сторонние файлы можно включать только для приложения?

В пакете есть package.json с аналогичной структурой. Вот кусок из package.json пакета d3, который зависит от внешнего d3.js: