Тогда так

Что-то не работает.

...function(data)
            {
                var sret = $(data);
                $('h2', sret).appendTo('#dh2');
                $('#ajaxload').stop().fadeOut(500);
               // $(sret).appendTo('#ajaxcontent');
                $('#ajaxcontent').stop().fadeIn(500);}...

Ровным счетом ничего не происходит.
Во-вторых, appendTo добавляет данные, к уже имеющимся, а мне нужно замещать.
Смотрел по доккументации функцию replaceAll но она не произвдит никаких видимых изменений.

А полностью код обработчика покажите? И то что в data ajax-ом возвращается?

По поводу замещения.. сначала почистите содержимое, а затем вставьте нужное.

function loadform(a)
    {$.ajax({url:a['href'],beforeSend:function(){opendlg();$('#ajaxload').fadeIn(500);$('#ajaxcontent').hide();},success:
                function(data)
            {
                var sret = $(data);
                $('h2', sret).appendTo('#dh2');
                $('#ajaxload').stop().fadeOut(500);
                $(sret).appendTo('#ajaxcontent');
                $('#ajaxcontent').stop().fadeIn(500);}})}

<div class="popup" id="dialog" style="display:none; z-index:10000">
    <div id="dh2">&nbsp;</div>
    <div id="ajaxload">
        <div style="text-align:center">
            <?= image('ajaxload') ?>
            <br clear="all" /><br clear="all" />
            <h3>Пожалуйста подождите, идет обработка данных........</h3>
        </div>
    </div>
    <div id="ajaxcontent">

    </div>
</div>

А возвращаем мы, к примеру, это

<h2>create tags</h2>
<script type="text/javascript">
    $().ready(function() {

        // validate signup form on keyup and submit
        $("#tag").validate({
            submitHandler: function(){formgears('#tag');}});
    })
</script>

<form action="<?= part_url('edt/savetags.htm') ?>" method="POST" id="tag">
    <div class="field">
        <?= form_labelinput('title', $title , 'tag_title') ?>
    </div>....

Кстати,

$(sret).appendTo('#ajaxcontent');

Работает. но

$('h2', sret).appendTo('#dh2');

НЕТ.
Пробовал вставлять все, потом вырезать - так работает, но как-то некрасиво.

Странно.

$('.field', sret).appendTo('#dh2');

работает.
Если весь кусок возвращаемого кода "обернуть" в div тогда все нормально.
Почему так?

<div>
<h2>create tags</h2>
<script type="text/javascript">
    $().ready(function() {

        // validate signup form on keyup and submit
        $("#tag").validate({
            submitHandler: function(){formgears('#tag');}});
    })
</script>

<form action="<?= part_url('edt/savetags.htm') ?>" method="POST" id="tag">

    <div class="field">
        <?= form_labelinput('title', $title , 'tag_title') ?>
    </div>
    <div class="field">
        <?= form_labelinput('tag', $tag, 'tag_tag') ?>
        <div class="notice"><?= lang('tag_not_required') ?></div>
    </div>
    <h4><?= lang('tag_descrypt') ?></h4>
    <div class="field">
        <textarea name="descr" rows="4" cols="20" id="descr"><?= $descrbb ?></textarea>
    </div>
    <h4><?= lang('acces_permission') ?></h4>
    <div class="field">
        <?= lang('user_group', 'usergroup'); ?>
        <?= form_dropdown('usergroup', $usergroup, $permission, 'id="usergroup"')  ?>
    </div>
    <div class="right field">
        <?= form_hidden('id', $id) ?>
        <?= form_hidden('oldtag', $oldtag) ?>
        <?= form_hidden('oldtitle', $oldtitle) ?>
        <?= $this->gears->submit('create') ?>
    </div>
</form>
<script type="text/javascript">
    SMarkUp.bind(
    'descr', //textarea id
    'bbcode', //makup configuration name
    120		//height of textarea
);
</script>
</div>

Потому что используя Вы выбираете дочерний узел h2. А он у вас на "нулевом" уровне, т.е. в коллекции $(sret); Поэтому в случае <h2><h2>Content</h2></h2> выбралась бы только внутренняя часть.
Используйте

$(sret).filter('h2');

Кстати,

function(sr)
            {
                data = $(sr);
                $('#dh2').empty();
                $('#ajaxcontent').empty();
                $('#dlgfooter').empty();
                $(data).filter('h2').appendTo('#dh2');
                $(data).filter('.sitefooter').appendTo('#dlgfooter');
                $('#ajaxload').stop().fadeOut(500);
                $(data).appendTo('#ajaxcontent');
                $('#ajaxcontent').stop().fadeIn(500);}})}

тоже не работает.