Ajax и получение ответа до полной загрузки страницы
 

for ($i = 1; $i < 10; ++$i)
{
echo $i;
sleep(1);
flush();
}

Могу ли я каким-то образом перехватывать события прихода каждой из циферок в отдельности, а не всех 9 в конце?

На каждую цифру по запросу или лучше без AJAX через iframe сделать, на сайте есть статья на эту тему.

PHP скрипт должен выполнить некоторое действие, например копирование нескольких папков с ФТП, понятно это займёт допустим минуты 3. Было бы неплохо, чтобы о процессе сообщалось допустим каждые 10 секунд (хотя бы о проценте скопированных файлов). Можно наверное сделать это через второй скрипт, а главный скрипт будет класть информацию в таблицу... но было бы удобнее всё сделать 1м скриптом.