Three js - полигоны
 

Имеется фигура, близкая к подобной:

https://threejs.org/docs/index.html#...hedronGeometry

Как задать ей расстояние между полигонами, чтобы раздвинуть их и создать эффект "распада"?

А как пробуешь?

Ну к примеру
1. разбиваешь фигуру на отдельные полигоны/треугольники
2. берешь вектор от геометрического центра фигуры к геометрическому центру полигона
3. Постепенно смещаешь полигон по полученному вектору будет эффект расхождения от центра фигуры.