Aetae,

Не удается сделать прозрачным ифрейм, он полностью закрывает pdf-ку.

Проверял все в FF.

При этом для других элементов он остаётся прозрачным? Или вы впринципе не можете сделать его прозрачным? Пробовали visibility:hidden или opacity:0?

У меня вообще отображение всякого дерьма в браузере окромя html и картинок отключено, так что проверить не могу. =)

И js??