В этих двух браузерах решил проблему при помощи проверки closed

setInterval(function(){
   if (win.closed) {
      exitWindow()
      return 0;
   }
}, 200)

И еще один маленький вопрос, можно ли как нибудь узнать, открыто ли сейчас окно?
Ситуация такая: Пользователь создает window.open, в переменную записывается ссылка на окно.
Но если пользователь не закрыв окно обновляет страницу в которой и была записана ссылка на window.open окна, то можно ли как нибуль после оновления страницы узнать открыто ли сейчас окно, которое пользователь открыл до обновления?

sessionStorage в помощь. Возможно через postMessage можно решить проблему.