Закрыть элемент при клике вне его
 

На сайте при клике на ссылку открывается невидимый слой, при клике на пункты, в пределах этого слоя выбирается элемент и слой закрывается (display: none) как сделать чтобы при клике в другое место документа (вне этого слоя) он закрывался...?

document.onclick

Проверяешь, если клик не на блоке - закрываешь.

это понятно, как проверить?

Я уже устал постить один и тот же код.
Получаем цель события в обработчике:

function onClick(evt){
evt=evt||event;
return evt.target||evt.srcElement;
}

И проверяем его id или ещё какие-нибудь данные.