JS во внешнем скрипте
 

<select id="myselect2">
  <option selected value="-1">Mr</option>
  <option value="2">Mrs</option>
  <option value="3">Ms</option>
  <option value="4">Dr</option>
  <option value="5">Prof</option>
</select>

var sel = document.getElementById("myselect2");
alert(sel);

Если JS в HTML то работает. Если JS во внешнем скрипте то не работает(null).
Помогите перенести во внешний скрипт

Дай ка угадаю: html ты пишешь скрипт после кода select'a, а внешний скрипт ты подключаешь до оного кода?

Точно! Спасибо.
А как можно сделать чтобы код писать в начале и чтобы работало?

Простой способ:

window.onload = function(){
//код здесь выполнится после загрузки страницы, скриптов и картинок
}

Правильный: DOMConctentLoaded.

P.S. Если ты ещё сам не понял: код твой не работает потому, что js выполняется сразу по мере загрузки и, соответственно, во втором случае на странице просто ещё не существует такого элемента.

Благодарю!