Как поставить переменную в код
 

assoc : function(type, name, program){
    _registrydb.assoc.1=""

Скажу сразу, это просто кусок кода, на самом деле он большой. На функцию передается name, и нужно в второй строке вместо вот этого 1 и подставить name. К примеру, если было assoc('','test','program'), то уже _registrydb.assoc.program , а не _registrydb.assoc.1 будет присваиватся "".
Сначала думал сделать что-то типо этого:

assoc : function(type, name, program){
eval(' _registrydb.assoc.' + name + '=""')

Но код очень большой, и все писать в евале тож не айс. Есть ли способ поадекватней? или все же писать в евале?

_registrydb.assoc[name] = ""

Это основы.

я подозревал, что оно так делается, делал что-то подобное, но не получалось. видимо не то делал.
а делал когда-то так:

_registrydb.assoc.[name]

, точка лишняя

во еще хочу спросить: а так тоже будет работать?

_registrydb.theme[el][arg]=''

Да.