Наверно надо не просто навести, а нажать.
Но alert - модальное окно, после появления оно блокирует все события на странице
Так, что не получится с алертом.
Вот так можно
<html>
<head>
<title>Form Test</title>
</head>
<body>
<a href="http://www.news.newmail.ru" onmouseover="if (confirm('Уже уходите!')) this.click();">Жмите сюда</a>
</body>
</html>