Ну на PHP вы же должны определить активную ссылку.
То есть если пользователь находится на главной странице то ссылка
<a href="#">Home</a>
будет выглядеть:
<a href="#" class="active">Home</a>
Если на другой странице, то в зависимости, ставите этот класс нужной ссылке.
А потом уже получаете активную ссылку:
var a_active = $('ul#nav li a.active');