Всё работает
<script src="http://code.jquery.com/jquery-1.6.4.min.js"></script>
<style>
div {width:64px; height:64px; background: red; display:inline-block}
</style>
<div>1</div> <div>2</div> <div>3</div>
<script>
objects = $("div");
objects.each(function (index) {
$(this).animate({opacity: 0}, 5000);
});
</script>