можно в цикле сначала перебрать все tr кроме первой
потом уже input
использовал jQuery для удобства
function feel() {
var digests = [[10,20,30,40], [10,20,30,40], [10,20,30,40], [10,20,30,40]];
$('#f1 tr:not(:first-child)').each(function (i, tr) {
$('input', tr).each(function (j, input) {
$(input).val(digests[i][j]);
});
});
}