function reload(){
var a = new Image()
a.src = "http://включает";
a.onload = function(){
setTimeout(function(){
new Image().src = "http://отключает";
},2000/*2 сек*/);
}
}
дальше назначить её обработчиком какого-нибудь события
<button onclick="reload()">обновить</button>
PS. а почему на javascript? чтобы был ярлычок на рабочем столе, нуужно делать это через curl или что-то подобное, но никак не через web-технологии.