Le-mark43 - спасибо тебе что наставил на пусть истинный. Я так хорошо прогнал оказывается. Действительно если данные полученны через ajax - то ничего jquery не вырезает. У меня же вырезало потому что в коде была записть такого вида:
var ajax_data = '<div>' + ajax_data + '</div>';
- поэтому собственно jquery и вырезал все теги script.
Второй же вариант с wrapper-ом - позволяет этого избежать. Просто в первом варианте видимо полученные данные преобразовывались в строку.
Вобщем задачу для себя я решил верно, а вот причину искал не там...