[beard]

<div id="clone" style="font-size:10px;"></div> 

<div id="img_id">
<div id="ne">
	<img id="main_img" src="" width="350" height="300" />
	<div id="wrapper">
            <div id="able">
   	    </div>
     	</div>
       
	</div>

$(".img_id").clone().attr("id", "clone_image").appendTo("#clone");

document.getElementById("clone_i mage").src = "src"

После клона появляется два элемента #img_id, соответственно document.getElementById("img_id") берет первый.