Так правильно:
function Class(){
this.qqq = function(){
alert("А не как хочется");
}
this.ggg = function(){
this.qqq(); // не работает такой способ вызова
}
}
var qqq = function(){
alert("Работает так как и должно!");
}
var t = new Class();
setTimeout(t.ggg, 1500);