Понятно вроде, но.... с куками, конечно, можно работать средствами js, но это скорее частный случай. Впрочем, это не важно. Важно, что Вам нужно показаться где и как Вы навешиваете куки. Если мы не знаем где и как Вы вешаете куки, то говорить не о чем.
Кстати, посмотрите функцию
setcookie. Там есть четвертый параметр - path - это тоже немаловажно.