[DjDiablo]

//WTF 1 ?
почему две обсолютно одинаковые функции вложены друг в друга ?

$(document).ready(function() {                   
    $(function() {

   });
});

// достаточно
    $(function() {

   });

//WTF 2 ?

<!-- в jquery так писать непринято. ->
<a href="#" onclick='$("#alert").overlay().load()'><h2>ALERT</h2></a>

<!-- следует писать -->
<a href="#" id="alertLink"><h2>ALERT</h2></a>

<script  type="text/javascript" >
    $(function() {
          //здесь ещё какойто код вроде $("#alert").overlay({ бла бла });        

           $("#alertLink").click(function(){
                 $("#alert").overlay().load();
                 //return false; //отменяет переход по ссылке (можете использовать если надо)
           });
    });
<script>

//WTF 3 ?
я невижу в вашем примере кода для функции overlay, ни обьявления, ни подключения скрипта с этой функцией