CYZ,
1) Необходимо для вашего диалога добавить
style="display: none;" (в bootsrap есть для этого класс hide)
2) при инициализации в опциях указать
show: false (т.е. не показывать сразу)
<html>
<head>
<meta charset="utf-8" />
<title>test </title>
<link href="css/bootstrap.css" rel="stylesheet">
<script type="text/javascript" src="js/jquery-1.8.3.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/bootstrap.js"></script>
<script type="text/javascript">
$(function () {
$('#myModal').modal({show: false});
});
</script>
<div class="modal" id="myModal" tabindex="-1" role="dialog" aria-labelledby="myModalLabel" aria-hidden="true" style="display: none;">
<div class="modal-header">
<button type="button" class="close" data-dismiss="modal" aria-hidden="true">?</button>
<h3 id="myModalLabel">Заголовок модального элемента</h3>
</div>
<div class="modal-body">
<p>Некое изящное тело…</p>
</div>
<div class="modal-footer">
<button class="btn" data-dismiss="modal" aria-hidden="true">Закрыть</button>
</div>
</div>
</head>
<body>
<a href="#myModal" role="button" class="btn" data-toggle="modal">Запустить демонстрацию модального элемента</a>
</body>
</html>