[ОлегА]

Deff, если после надо что бы окно опять на онклик закрывалось?придется ведь опять биндить, я бы попробовал так сделать:

$("div#cover").bind('click',function(){
    zIndex_fon = $(this).css('zIndex'); // zIndex - фона
    zIndex_mod = $('#modal-window').css('zIndex'); // zIndex  - модальное окно
    if(zIndex_fon < zIndex_mod){ // т.е. окно будет закрываться только, если фон будет позади модального окна
        // тут код закрывающий окно
    }
});