Brook,
Ваш код срабатывает
до того момента, когда документ полностью загрузился. Нужно исправить так:
<html>
<head>
<script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.js"></script></head>
<body>
<script>
$(function() { // пишем необходимый код в document ready
var id='#two';
$(id).html('123');
});
</script>
<div id="two"></div>
</body>
</html>