Нет, не высоконагруженное. Но если нет разницы, зачем платить больше? Еще в jQuery $elem.data('id') практически равен $elem.attr('data-id').
Т.е. <div data-id="9"></div> $('div').data('id') вернет 9, хотя обратная запись работать не будет. Дата-атрибуты можно использовать как значения по-умолчанию, больше плюсов в них не насмотрел...