В зависимости от условия должен исполнятся тот или другой скрипт...
<HTML>
<HEAD>
<SCRIPT LANGUAGE="JavaScript">
function askuser() {
var answer=" "
var answer=prompt("1 или 2 ?")
if (answer == "1")
{script.src = "odun.js"}
if(answer == "2")
{script.src = "dva.js"}
}
</SCRIPT>
</HEAD>
<BODY>
<h2>цифра</h2>
<FORM>
<INPUT TYPE="button" VALUE="Жми!" onClick="askuser()">
</FORM>
</BODY>
</HTML>