[Demath]

Двойной цикл здесь не нужен

var n = arr.length, count1 = 0, count2 = 0;

    for (var i = 0; i < n; i++) count1 += arr[i][i];     // Главная диагональ

    for (var i = 0; i < n; i++) count2 += arr[i][n-1-i]; // Побочная диагональ