[Vlasenko Fedor]

чтобы они не игнорировались должен быть явно задан атрибут position

Че?

<button id="myButton" onclick="myFunction()">Click to move</button>
    <script>
      function myFunction() {
        var mleft = +myButton.style['margin-left'].replace('px', '') + 50; //slice(0, -2)
        myButton.style['margin-left'] = mleft + 'px';
      }
    </script>