[Octane]

Лень разбираться с этим gulpjs, раз у вас nodejs на сервере, значит можно написать что-нибудь типа такого:

var fs   = require("fs"),
	css  = "<style>"  + fs.readFileSync("main.css")  + "</style>",
	html = "<div>"    + fs.readFileSync("main.html") + "</div>",
	js   = "<script>" + fs.readFileSync("main.js")   + "</script>";

fs.writeFileSync("index.html", css + html + js, "utf8");