[Sweet]

как потом вызвать все это без eval

.apply же:

var a=[
    {
        name: 'имя метода1',
        args: ['значение1',...,'значениеN1']
    },
    {
        name: 'имя метода2',
        args: ['значение1',...,'значениеN2']
    }
];

a.forEach(function (item) {
    this[item.name].apply(this, item.arguments);
}, window/*или что-нибудь ещё, где методы хранятся*/);